1. Такой вариант, который ты просишь, удобнее для тех, кто привык делать отчетность, то есть для предпринимателей. Систему пока сделали как домашнюю, хотя пожелания предпринимателей тоже обещано когда-то учесть.
2.+ 4. Дело в том, что идеология системы подразумевает "первичность" классификаторов по отношению к операциям, поэтому ожидается, что они уже устроены до заполнения конкретных операций. Создавать классификатор, когда программа подсказывает ВЫБРАТЬ его, это неадекватная реакция пользователя.
3.Сделай операцию перевода - заполнится.
5. Это на вкладке отчетов, что-ли?
Поставив птички на двух счетах следует ожитать результат - отчеты и по одному и по другому счетам, причем по приходу - если операции были прихода на счет, а не перевода на счет. Я, например, работаю только переводами (аналог двойной записи, позволяющий вести простенький складской учет - компы считаешь валютой К, цена - это курс между К и $, отгрузка ПЕРЕВОД нескольких К в $ на счету взаиморасчетов с покупателем, получение денег - перевод со счета взаиморасчетов на  счет наличных и т.д.)